Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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APOFQ13790 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
APOFQ13790 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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APOFQ13790 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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APOFQ13790 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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APOFQ13790 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
APOFQ13790 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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