Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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BFSP2Q13515 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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BFSP2Q13515 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BFSP2Q13515 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BFSP2Q13515 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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