Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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