Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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