Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SKP2Q13309 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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SKP2Q13309 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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SKP2Q13309 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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