Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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