Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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TRAF1Q13077 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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TRAF1Q13077 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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TRAF1Q13077 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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TRAF1Q13077 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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TRAF1Q13077 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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TRAF1Q13077 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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