Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRDM2Q13029 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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