Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
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