Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SREBF2Q12772 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms