Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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HOXD1Q9GZZ0 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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