Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GINS3Q9BRX5 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GINS3Q9BRX5 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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