Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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