Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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CCDC47Q96A33 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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CCDC47Q96A33 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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CCDC47Q96A33 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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CCDC47Q96A33 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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CCDC47Q96A33 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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CCDC47Q96A33 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
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CCDC47Q96A33 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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CCDC47Q96A33 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CCDC47Q96A33 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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