Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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