Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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HIF1AQ16665 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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