Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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