Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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SSX1Q16384 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
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SSX1Q16384 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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SSX1Q16384 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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SSX1Q16384 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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