Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ZFHX3Q15911 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms