Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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