Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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