Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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