Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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