Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXF2Q12947 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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