Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms