Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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