Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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COPS7AQ9UBW8 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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