Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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