Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms