Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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