Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX2Q16385 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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SSX2Q16385 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SSX2Q16385 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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