Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZFHX3Q15911 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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