Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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