Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NECTIN1Q15223 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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