Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SCN5AQ14524 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SCN5AQ14524 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SCN5AQ14524 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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