Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
COL4A6Q14031 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms