Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
APOFQ13790 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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APOFQ13790 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
APOFQ13790 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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