Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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TUBB3Q13509 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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TUBB3Q13509 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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TUBB3Q13509 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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TUBB3Q13509 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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TUBB3Q13509 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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TUBB3Q13509 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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TUBB3Q13509 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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