Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KLF1Q13351 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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