Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms