Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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