Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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BPTFQ12830 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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BPTFQ12830 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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BPTFQ12830 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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BPTFQ12830 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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