Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRGP23470 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms