Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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