Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
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