Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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TRIM63Q969Q1 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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TRIM63Q969Q1 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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TRIM63Q969Q1 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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TRIM63Q969Q1 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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TRIM63Q969Q1 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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TRIM63Q969Q1 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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TRIM63Q969Q1 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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TRIM63Q969Q1 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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TRIM63Q969Q1 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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