Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL24A1Q17RW2 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL24A1Q17RW2 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms