Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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