Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CYTH1Q15438 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CYTH1Q15438 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CYTH1Q15438 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CYTH1Q15438 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CYTH1Q15438 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CYTH1Q15438 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CYTH1Q15438 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CYTH1Q15438 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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