Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.18
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PTPRKQ15262 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
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PTPRKQ15262 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
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PTPRKQ15262 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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PTPRKQ15262 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRKQ15262 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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